A saga Naruto se desenvolve como uma luta de diversas partes pelo último dos Uchihas, Sasuke, e as Bijuus, além dos hospedeiros delas, dos quais Naruto faz parte. Amigos, Sasuke e Naruto foram criados como órfãos, mas desenvolveram a rejeição de maneira diferente. Enquanto um busca vingança contra um irmão que na verdade foi seu protetor, o outro busca proteger seus amigos, inclusive Sasuke. A batalha entre a Akatsuki e a Aliança Shinobi vai até o fim, e só termina pois Naruto nunca desistiu de Sasuke.